یکی از دعاهای این فیلسوف زاهد این بود که می گفت : " خدایا به اندازه ظرفیت وجودی ما به ما مقام و مرتبه و شهرت و ... بده تا شکرگزارت باشیم " خدایش رحمت کند عجب مومن دوست داشتنی بود تا نگردی آشنا زین پرده رمزی نشوی \گوش نامحرم نباشد جای پیغام سروش. روح ملکوتیش شاد و قرین غفران واسعه الهی ان شاء الله حداوند روح استاد رابا حضرات معصومین محشورگرداند انشاءالله خداوند به ما توفیق رسیدن به این درجات رامابدهد حسين آرام جانم حسين روح و روانم..... علامه جعفری مردی بزرگوار بود با برترانراسل مکاتبه میکرد بی آنکه به او انگ بزند با بزرگان دین هم مباحثه میکرد بی آنکه مجیز بگوید،اهل بحث ونظر بود،حالا با هر اعتقادی ،یادش گرامی باد. 
روحش شاد و راهش پر رهرو باددوستی که باور نکردند شاید بد نباشد که مطالعه بیشتری در احوالات این بزرگان داشته باشند.
محمد از هلند
ما کجا و اینها کجا؟
علامه جعفری-علامه امینی- علامه طباطبایی
روح این بزرگواران دعاگوی ما هم باشد ان شاءالله