به گزارش تابناک درحالی که برخی سایتهای خبری از قرار دادن پرچم سه رنگ ایران بر روی پیکر همسر و فرزند کیان انتقاد داشتند و این مسئله را یک گاف تاریخی برای این سریال به حساب آورده بودند سایت رسمی سریال مختارنامه نوشت:
پرچم سه رنگ «پرچم قیام مختار» است نه پرچم ایران! هر یک از این رنگ ها نیز معرف یکی از جناح های لشگر مختار است که پیش از این و در قسمت مربوط به پیروزی قیام مختار، هنگام ورود مختار به کاخ دارالعماره نیز مورد اشاره قرار گرفته است و حالا قرار دادن آن بر روی پیکر همسر و فرزند کیان به معنای ادای احترام به آنها است، نه به معنای قرار دادن پرچم ایران!