سیدداوود میرباقری با اشاره به سختی شخصیت‌پردازی و توصیف فضاها در مختارنامه به برخی ابهامات این سریال پاسخ داد.
به گزارش «۲۴»، کارگردان سریال «مختارنامه» درباره حذف صحنه قتل ابن زیاد توسط ابراهیم مالک اشتر، گفت: «تصویری که ما در این مجموعه از ابن‌زیاد نمایش دادیم، بر اساس تاریخ بوده و اینکه برخی شبهه کردند بنا به دلایلی خاص صحنه‌های مربوط به کشته‌شدن ابن‌زیاد از مجموعه درآمده این طور نیست.»
وی توضیح داد:« بعد از خروج فضاحت‌بار ابن‌زیاد از کوفه که زیر شکم شتری، مسافت زیادی را طی می‌کند، از لحاظ روانی دچار مشکل می‌شود که این مشکلات را در جریان جنگ با پسر مالک می‌بینیم.»
میرباقری اضافه کرد: «نشان دادن صحنه کشته‌شدن آدم مقتدری که به این وضعیت ذلت رسیده، باعث می‌شد چهره مظلومی از او در پایان کارش در سریال به جا بماند و برای همین تصمیم گرفتیم این صحنه به تصویر کشیده نشود.»
وی همچنین با اشاره به سختی‌های ساخت این مجموعه گفت: «در این مجموعه ۵۶ نفر از شخصیت‌های اول، دوم و سوم کشته می‌شوند، که اغلب در جنگ و یا تقابل‌های فردی با شمشیر و نیزه و خنجر و...کشته می‌شوند، اینکه ما ضمن طراحی‌های متنوع برای جنگ‌های متعدد، این تعداد کشته را نیز با تنوع و بدون تکرار نشان دهیم، واقعا سخت بوده که تلاش‌مان را کردیم حداقل کشته‌شدن همه به یک شیوه نشان داده نشود.»
وی در خصوص صحنه‌هایی که از قسمت‌های آخر این مجموعه به بینندگان توصیه شده بود، در صورت ناراحتی قلبی، از دیدن‌ش خودداری کنند، نیز گفت:« در تاریخ خشونتی که علیه ایرانیان وجود داشته به هیچوجه قابل پخش از تلویزیون نیست و این غریب‌کشی ایرانیها برای من بسیار آزاردهنده بود و تلاش کردیم تا حدی این قتل‌عام را نشان بدهیم.»
میرباقری همچنین درباره شخصیت‌پردازی این مجموعه گفت:« تلاش من این بود که حتی درباره شخصیت‌های منفی این مجموعه، بی‌طرفی روایت را رعایت کنیم.»
بنابراین گزارش، میرباقری که در برنامه پارک ملت حاضر شده بود، در خصوص موسیقی این سریال نیز گفت: «آنچه در ذهن داشتم این بود که تم کلی این اثر در حوزه موسیقی باید بغض فروخورده یک زن باشد. فریادی که گویا نتوانسته به گوش تاریخ برسد.» وی در توضیح این ذهنیت به مظلومیت حضرت زهرا(س) و شهادت و تشییع و تدفین مظلومانه ایشان اشاره کرد.
بایدچیزی که درتاریخ اتفاق افتاده به واقعیت نشان داده شودنه اینکه به میل و سلیقه نشان داده شود 
اگر قرار باشد همه وقایع مو به مو نشان داده شود که دیگر سریال نیست می شود کتاب تاریخ. 
