بر اساس اعلام رئیس کمیته استیناف صدور مجوز حرفه‌ای، اصلی‌ترین موضوع مورد توجه کنفدراسیون فوتبال آسیا در ماجرای حذف نمایندگان فوتبال ایران عدم پرداخت بدهی کالدرون از سوی باشگاه پرسپولیس بوده، با این وجود بر اساس مستندات موجود علاوه بر مسئولان پرسپولیس، مدیران سابق استقلال هم در این داستان نقش آفرین بودند.
طبق نامه‌ای که در تاریخ 8 مهرماه به باشگاه استقلال ارسال شده، مدیران پیشین این باشگاه در روزهای 24 و 29 شهریور نامه‌هایی را در خصوص نقص مدارک و مستندات مورد نیاز جهت ثبت در سامانه CLAS دریافت مجوز حرفه‌ای دریافت کرده بودند اما شواهد نشان میدهد که این هشدارها مورد توجه قرار نگرفته و پروسه حرفهایسازی که باید از اواخر سال 1399 در باشگاه استقلال آغاز می‌شد در مسیر درستی قرار نداشته است.
سازمان لیگ در تاریخ 8 مهر و تنها چهار روز بعد از انتخاب مدیرعامل جدید استقلال در نامه‌ای به مکاتبات قبلی خودش با این باشگاه اشاره کرده و در این خصوص یادآور شده است: «متاسفانه تلاش‌های مسئولان مجوز حرفه‌ای باشگاه استقلال با توجه به اعلام نواقص و یادآوری‌های لازم کافی نبوده و مدارک مربوطه در سیستم CLAS به شکل کامل بارگذاری نشده است.»
این نامه به امضای حیدر بهاروند رئیس سازمان لیگ روز پنج شنبه 8 مهرماه به مدیران باشگاه استقلال ابلاغ شده است، آن هم در شرایطی که تنها 48 ساعت زمان برای ارائه مستندات لازم باقی مانده بود و مسئولان جدید بخش مجوز حرفه‌ای این باشگاه در روزهای پنجشنبه و جمعه نسبت به ثبت بخشی از مدارک اقدام کردند اما حسابرسی مالی سالانه باشگاه استقلال که باید در خردادماه سال جاری انجام می‌شد صورت نگرفته و مدارک مرتبط با آن که لازم بوده ترجمه شود طبیعتاً در این فرصت کوتاه آماده ارائه به AFC نبود. تسویه حساب مالیاتی و تعیین تکلیف بدهی سنگین این باشگاه که بیش از 200 میلیارد تومان اعلام شده بود در روزهای پنجشنبه و جمعه و در 48 ساعت قابل انجام نبود و حتی اقدامی در جهت افزایش سرمایه این باشگاه به دلیل زیان انباشته سالیان گذشته در این مدت صورت نگرفته بود.
