11 تيرماه سال 1361، همزمان با نوزدهم ماه مبارك رمضان، يكي از تروريستهاي بازي‌خورده سازمان مجاهدين خلق با نزديك شدن به آيت‌الله صدوقي، بمبي را منفجر كرد و علاوه بر هلاكت خود امام جمعه يزد را به شهادت رساند.
امسال مراسم بزرگداشت آيت‌الله صدوقي سومين شهيد محراب با حضور آيت‌الله هاشمي در تهران برگزار مي‌شود. همچنين در يزد، شوراي هماهنگي تبليغات اسلامي مراسمي را با دعوت از حجت‌الاسلام و المسلمين سيد احمد خاتمي ترتيب خواهد داد.
محمد علي صدوقي در کنار پدر (شهيد آيت‌الله صدوقي)
شهيد صدوقي و حجت الاسلام و المسلمين مرحوم فلسفي
مراسم تشييع پيکر آيت‌الله صدوقي
شهيد صدوقي و آيت‌الله سيد جلال الدين طاهري
شهيد صدوقي و شهيد صياد شيرازي
شهيد صدوقي و مهندس علي اصغر گرانمايه (استاندار اسبق يزد) و حاج علي اکبر رئوف (مديرکل اسبق آموزش و پرورش يزد)
شهيد صدوقي و مرحوم آيت‌الله خاتمي در محضر امام
روحش شاد وراهش پر رهرو