به گزارش «تابناک»، دکتر سیما مشایخی،فوق تخصص جراحی سرطان در روزنامه شرق نوشت:دکتر ملکزاده را از روزی که به دانشگاه شیراز وارد شدم، می‌شناسم.ایشان به عنوان استادی با نگرش علمی و به عنوان پزشکی دلسوز و طبیبی که به پزشکی براساس شواهد اعتقاد داشت، همیشه مورد احترام جامعه پزشکی و شاگردانشان بوده است.
در این یادداشت، هدف بررسی کارنامه کاری ایشان نیست که قطعا نقاط قوت و ضعف خود را دارد و در حوصله این نوشته نبوده و نیاز به کارشناسانی بی‌طرف و دلسوز دارد. هدف نگارنده دفاع تمام‌قد از انتقاداتی است که ایشان به اعتراض نسبت به آنها استعفا داده است.
در معرکه همپوشانی موج دوم و سوم کرونا، مرگ‌ومیرهای روزانه بالا و مشکلات اقتصادی ناشی از سوءمدیریت و تحریم‌های همه‌جانبه، به جای اینکه وزارت بهداشت که متولی امنیت بهداشتی جامعه و حافظ جان هموطنان گرفتار به بیماری کروناست، به رویکردهای علمی جامعه جهانی، پیشرفت‌های روزانه و تجربیات علمی کادر درمانی درگیر با بیماران کرونا توجه داشته باشد، مشغول افتتاح درمان‌های غیرعلمی، آزمایش‌نشده و غیراستاندارد طب سنتی برای مواجهه با بزرگ‌ترین بیماری قرن است.
درمان‌های حاشیه‌ای و غیرعلمی از جمله طب سنتی و گیاهی (بدون گذراندن مراحل علمی برای اثبات اثر) در همه کشورها وجود دارند و این موضوعی نیست که بتوان آن را حذف کرد. اما موضوع اصلی دفاع و حمایت مهم‌ترین مدیر سازمان علمی، بهداشتی و درمانی ایران یعنی دکتر نمکی از این روش‌های عجیب است.
لازم است متذکر شوم خیلی از داروهای مورد استفاده و استاندارد در پزشکی از گیاهانی تهیه میشود که همه مراحل اثربخشی را در تریال‌های علمی و استاندارد طی کرده‌اند اما اینکه وزیر بهداشت و درمان یک کشور، معرکه مدعیان استفاده از درمان‌های سنتی را این‌چنین جانانه حمایت کند و در مقابل اعتقادات علمی معاون پژوهشی و فناوری خود که فردی شناخته‌شده در جامعه علمی بین‌المللی است، بایستد و در دفاع از شبه‌علم، علم را زیر سؤال ببرد، برای جامعه پزشکی و مردمی که وزارت بهداشت را معتمد سلامت خود می‌دانند یک علامت سؤال بزرگ است.
استعفای دکتر علی نوبخت که خود در به‌وزارت‌رسیدن دکتر نمکی نقش مهمی داشته، اعتراضی دیگر در مقابل شبهات تأثیر درمان‌های غیرعلمی در مواجهه با کرونا و هر بیماری دیگر و عملکردهای بخشی از وزارتخانه است. به عنوان پزشکی مستقل که انتقادات جدی به مدیریت کلان به‌ویژه سیاست‌های بهداشتی و همین‌طور پژوهشی دارد، لازم می‌دانم از مقابله با اقدامات غیرعلمی و غیراخلاقی و اقتدای پزشکانی مانند دکتر ملکزاده به علم و فقط علم با تمام قوا دفاع کنم و از همکاران خودم که دلسوزان بهداشت و درمان در این سرزمین عزیز هستند، می‌خواهم در این وادی به دفاع از علم برخیزند .
خدا خواست که وزرات بهداشت از دست ملک زاده راحت شود...دفاع الکی نکنید که ملک زاده غملکردش هیچ جای دفاعی نداره 
طرف بیست سال تو سمتش لونه کرده بود و 
