به گزارش تابناک، برخی از کاربران گزارش کرده‌اند که قادر به ثبت درخواست‌های خود نبوده و یا با خطا‌های مکرر در حین استفاده از سامانه مواجه شده‌اند. این اختلال باعث نارضایتی و سردرگمی بسیاری از ایرانیان خارج از کشور شده است
وزارت امور خارجه هنوز به طور رسمی درباره علت این اختلال و زمان برطرف شدن آن اطلاع‌رسانی نکرده است. کاربران از این وزارتخانه خواسته‌اند تا هر چه سریع‌تر اقداماتی برای رفع مشکلات انجام داده و اطلاعات لازم را در اختیار آنها قرار دهد.
انتظار می‌رود با تلاش‌های فنی، این اختلالات به زودی برطرف شود و سامانه میخک به حالت عادی خود بازگردد.
بر حسب تجربه به عنوان کسی که چند سال هست خارج از کشور کار می‌کنه، سامانه میخک عالیه، ولی وقتی رایزن‌ها قصد صدور تاییدیه مشکل‌دار دارند، تاییدیه را خارج از سامانه میخک صادر می‌کنند. 